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氨基酸的制备组成蛋白质的大部分氨基酸是以埃姆登-迈耶霍夫（Embden－Meyerhof）途径与柠檬酸循环的中间物为碳链骨架生物合成的。例外的是芳香族氨基酸、组氨酸，前者的生物合成与磷酸戊糖的中间物赤藓糖-4-磷酸有关，后者是由ATP与磷酸核糖焦磷酸合成的。微生物和植物能在体内合成所有的氨基酸，动物有一部分氨基酸不能在体内合成（必需氨基酸）。
必需氨基酸一般由碳水化合物代谢的中间物，经多步反应（6步以上）而进行生物合成的，非必需氨基酸的合成所需的酶约14种，而必需氨基酸的合成则需要更多的，约有60种酶参与。生物合成的氨基酸除作为蛋白质的合成原料外，还用于生物碱、木质素等的合成。另一方面，氨基酸在生物体内由于氨基转移或氧化等生成酮酸而被分解，或由于脱羧转变成胺后被分解。
氨基酸的来源氨基酸的来源主要可以分成两类：一是食物来源，二是非氨基酸物质的转化。食物来源主要是把摄入的蛋白质经过酶的处理，分解成氨基酸，这种途径可以获得必须氨基酸和非必须氨基酸。而非氨基酸物质的转化则是将体内的糖类或脂肪经过一系列的转化，最终转化成氨基酸，这种途径只能够得到非必须氨基酸。
光合作用是不能够直接产生氨基酸的，只能够产生糖类。
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