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民办本科与公办本科在经费来源、生源选择和学费标准、教学方向、含金量、学校氛围以及录取分数线、师资力量等方面有区别：
1、经费来源不同：民办大学一般由非地方或者中央政府投资，全部或者部分的依靠学生的学费来维持大学的经营而非公共资金，而公办大学是国家组建的大学，国家提供部分资金建立，经费全部来自国家拨款。
2、生源选择和学费标准不同：民办大学的学费比公立大学的高，校方有权自主选择生源，而公办大学的学费以国家规定为准，相比民办大学较低。
3、教学方向不同：民办大学依托市场生存,设立课程面对市场需求,而公半大学承担国家高等教育的使命,偏重基础学科的研究和教学。
4.含金量
虽说是二本院校，但由于生源、师资、学校等因素，目前很多社会中的企业并不是十分认可民办院校的毕业生，总认为民办院校的学生不如公办院校。但实际上，民办院校一些专业可能会更突出一些，并且民办院校由由企业出资，所以有时会有很多活动资源可以让同学们去参加或锻炼，可见并非民办高校毕业的同学能力更弱。
5.学校氛围
通常情况下，由于民办大学的录取分数较低，所以生源的学习水平比较一般，加之上了大学后，很多同学开始贪图玩乐，疏于学习，所以学习氛围相对较弱一些。不过，这也只是一个平均水平，无论是哪个学校，都有喜欢且擅长学习的同学，只要自己保持学习的积极性，足够勤奋、自律，无论是公办还是民办，都能在大学毕业时由一个不错的成绩。
6.录取分数线
就录取方面而言，民办院校的分数会更低一些。大家在填报志愿时就已经知道，高校分别属于不同的批次，提前批、本科一批、本科二批，而本科二批当中还会分A、B、C三类，大部分公办院校属于靠前的批次，而许多民办院校属于二批C类，所以在录取时，批次靠前的学校，录取分数通常会更高一些。
7.师资力量
通常情况下，民办高校的师资力量会弱一些，但并不意味着老师不好。公办大学的老师通常都有十分丰富的经验，在招聘时对应聘者的要求较高，并且会由教育部、教育局不定期的调动优秀的教师到各个高校教学，师资力量更为雄厚一些。而民办大学的老师大多为合同制，流动性较大，工作并不稳定，不过正是由于民办高校的企业性质，老师的绩效与工作息息相关。
公办和民办大学应该如何选择
一般来说，大多数选择民办高校的学生都是因为高考成绩在本科线边缘，为了稳妥一些就选择了民办高校。但是不一定所有的学生都能负担得起民办高校高昂的学费的，四年民办高校的学费会比普通公办高校多花10万元左右，所以如果大家能选择公办高校的情况下一定要优先考虑公办高校。
虽然说公办和民办高校都是国家承认的高等学府，在奖助学金等的评奖、评优政策上也是一致的，但是相比起公办高校来说，可能公办高校的学习氛围和学术环境会更好一些，公办高校也会更加偏向于教学质量的管理。
此外，在社会认可度上民办大学是不及公办大学的，但是这个事情也不能一概而论，就现在的发展情况来看，公办大学和民办大学的差别也正在逐步缩小。
具体怎么选择，如果你的家庭经济条件允许并且民办高校有你想学的专业，或者说你的成绩就在二本线边缘徘徊，不报民办高校滑档到专科院校的可能性很大，那就优先选择民办高校。
如果你的成绩还是可以选择一个公办高校的，那就尽量选择一个公办高校，大家如果能上本科就一定优先选择本科，不要现在就想着将来自己再去参加专升本考试，国家统招专升本和普通本科还是有一定的区别，所以大家尽量一步到位。
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