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一， 办学性质。
独立学院一般都是挂靠在某个本科以上学历教育的普通高等学校之下，如：××大学××学院。独立学院是公办大学与社会组织或个人合作开办的，属于公益性事业，其办学经费不是来自于国家财政。民办院校是指国家机构以外的社会组织或者个人开办的，与公办单位没有关系，这也是称之为“民办院校”的本来之意。但只要是列入招生计划的，纳入国家统一招生的，考生都可以填报，不存在“真”和“假”的区分。
二， 办学水平。
挂靠在某个大学的独立学院，一般和原大学之间都有协议，大学会对挂靠的独立学院提供科研、师资等方面的支持，所以说，独立学院的办学水平，与挂靠的原大学有很大的关系。通常，挂靠的原大学名气越高，独立学院也会吸引考生的填报，相应的录取分数线较高。
民办院校虽然没有以上独立学院的这个优势，但并不是说，所有的民办院校办学水平就低，有些优秀的民办院校，由于有雄厚的资金支持，对就业专业的热度的把握得当，其毕业生的就业前景也很好。
三， 办学层次。
独立学院只招收本科生，有的独立学院的办学地点是在挂靠大学的某个校区，或者有的就是和原大学在同一个校园。民办院校有自己独立的学校场地，其不仅招收本科生，还招收专科生，有些民办院校还举办一些短期的职业培训业务。
四， 毕业与就业。
无论是独立学院，还是民办院校，本科学生毕业时，都会统一授予毕业证书和学士学位证书，其所加盖的就是学校名称的章，如：××大学××学院，或者是××学院。独立学院和民办院校所开设的专业，一般都是比较热门的专业，就业前景都还不错。
五，费用。
民办本科院校学费和独立学院学费通常在1万6千元到2万元之间，如果四年本科下来，再加上住宿等除生活费以外，十万元应该说只够，对于一般的家庭而言，是一个不小的数字。但是从学生的学习和成长的角度来看，这些成本是不算什么的，当然，不同的考生和不同的家庭，要视具体情况而定，要综合考虑，权衡再三。
独立学院与民办学校毕业后是否被认可
凡列入招生计划的公办学校和民办学校、独立学院都必须是经国家批准或备案的具有高等学历教育招生资格的学校，教育部定期公布具有高等学历教育招生资格学校的名单，就不具备高等学历教育招生资格的学校，不能纳入国家统一招生。民办学校、独立院校的招生列入国家计划的，其毕业生国家是承认学历的，毕业证书可以在中国高等教育学生信息网上查询。
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