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不一样。独立学院的毕业证书上盖的章是独立学院的章，而学校本部的学生毕业证上的章则是学校本部的印章，所以两者的毕业证还是有区别的。
独立院校是公办还是民办
独立学院是民办高等教育的重要组成部分，属于公益性事业，依法享有民办教育促进法、民办教育促进法实施条例规定的各项奖励与扶持政策；由省、自治区、直辖市人民政府教育行政部门主管本行政区域内的独立学院工作。
申请正式设立独立学院，审批机关应当按照民办教育促进法规定的期限，作出是否批准的决定。批准的，发给办学许可证；不批准的，应当说明理由。
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