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学校创办于1934年，时名湖南国医专科学校，1960年改办为普通高等本科院校湖南中医学院，1990年原湖南科技大学成建制并入湖南中医学院，2002年湖南省中医药研究院与湖南中医学院合并，2006年经教育部批准更名为湖南中医药大学。2012年学校进入一本招生序列。目前学校与湖南省中医药研究院实行校院合一的管理体制。
学校现有含浦、东塘2个校区，总占地面积1000余亩，校舍建筑面积47万平方米。现有3所直属附属医院，13所非直属附属医院，5个校办合资企业。学校下设17个学院、16个研究中心（所）。学校现有学生总人数46006人，其中研究生1843人、全日制本科生18339人、专科生189人、成人学历教育学生22222人、境外学生407人。学校图书馆藏书109.7万册，线装古籍2.5万余册。拥有教学科研仪器设备总值1.50亿元，有40万元以上的贵重仪器设备17台件、多媒体教室165间，建成了先进的校园网络和多媒体教学、教室监控、教学广播、会议视频、屏蔽系统。
学校始终把提高教学质量作为第一要务来抓，不断创新教育理念，优化专业结构，深化教学内容、课程体系与实践教学改革，强化中医本科人才临床（诊疗）思维和实践能力的培养，实施了农村订单定向免费医学生（中医学）培养项目，实施了临床型拔尖中医人才培养体制的构建与实践改革试点项目，大力推进素质教育，取得了显著成效。目前，学校开设24个本科专业，分属于医学、理学、工学、管理学、文学5个学科门类。现有4个国家级特色专业建设点，7个省级特色专业建设点；国家级本科专业综合改革试点1个，省级本科专业综合改革试点2个。学校现有国家级精品课程1门，国家级精品资源共享课1门，省级精品课程9门。学校历来重视人才培养工作，本科生参与课外科技活动的普及率不断增高，获得各类国家级、省级学科和科技竞赛奖百余项，近3年本科毕业生年终就业率平均为96.5%，位居全省高校前列。
学校构建了以医学学科为主体，医、理、工、管、文等学科门类协调发展的学科体系。拥有中医学、中西医结合2个博士后科研流动站。现有一级学科博士学位授权点1个，二级学科博士学位授权点22个，其中8个二级学科自主设置博士学位授权点；一级学科硕士学位授权点4个，二级学科硕士学位授权点41个，其中17个二级学科自主设置硕士学位授权点。
学校形成了国家、省、学校三级重点学科体系，基本实现了湖南省建设教育强省规划中对高校重点学科建设的要求，并形成了鲜明的中医药学科特色与优势。有国家重点学科1个，国家中医药管理局重点学科23个，湖南省重点学科10个，其中湖南省优势特色重点学科2个。中医诊断学在本学科研究领域居国内领先水平。学校的优势科研项目有病证诊疗标准化与客观化研究，中药超微技术与创新药物研究，针灸——经络原理研究，妇科血症研究，中药材育种、栽培、管理、标准化研究，心脑血管病、肝病、肿瘤、糖尿病、眼底病、免疫性疾病等疑难重大疾病的防治研究，并打造了相应的科技创新团队。
学校建设了一支结构合理、素质高、富有创新精神的师资队伍。现有在职教职工1876人，其中专任教师和实验室人员1254人；具有正高职称教师211人、副高职称教师302人；有博士生导师108人、硕士生导师422人。有国家有突出贡献的中青年专家4人，卫生部有突出贡献的中青年专家2人，卫生部先进工作者1人，享受国务院政府特殊津贴的专家59人，享受省政府特殊津贴的专家2人，国家“百千万人才工程”国家级人选1人，国家级优秀教师2人。湖南省“121人才工程”第一层次人选4人，湖南省高层次卫生人才“
学校注重科技平台的建设，建设有国家级3个、部级21个、省级14个、厅级13个。其中，有国家重点实验室培育基地1个、国家中医（肝病）临床研究基地1个、国家发改委工程实验室1个；教育部工程研究中心1个、重点实验室1个，国家中医药管理局重点研究室2个、国家中医药管理局三级中医药科研实验室11个、国家中医药管理局二级中医药科研实验室6个，国家中医药管理局中医药基地1个；湖南省2011协同创新中心1个、湖南省重点实验室3个、湖南省工程技术中心3个、湖南省特色创新服务平台1个、湖南省工程实验室2个，湖南省中医药文化研究基地1个、思想政治工作研究基地1个；湖南省普通高等学校重点实验室6个、湖南省中医药管理局重点研究室5个。有SPF级实验动物中心1个、国家级科普基地5个。所有科技实验平台实行校院两级管理，对全校学生预约开放。
目前学校有在研课题688项，纵向在研科研经费6600余万元，参与973计划项目14项、863计划项目4项，获批国家科技重大专项4项、国家重大新药创制2项、国家科技支撑计划项目10项、国家自然科学基金课题104项、国际合作专项2项。2000年至今，学校共获国家级及省部级科技成果奖106项，其中“中药超微粉体关键技术研究及产业化”成果于2009年获国家科技进步二等奖。开发中药新药51个，获科技成果转让84项、国家专利205项、科技开发和新药转让费9958.3万元。学校有直属附属医院3所，非直属附属医院12所，共有病床14789张。第一附属医院被列为国家中医临床研究基地建设单位，第二附属医院被列为全国重点建设中医院，附属中西医结合医院为十所全国重点建设中西医结合医院之一。附属医院医疗设施先进，临床科室设置齐全，拥有一批知名的中医临床专家。拥有肝病、眼底病、皮肤疮疡病、肛肠病、儿科、骨伤科、不孕不育科、心血管内科、针灸科、脑病、肿瘤等11个国家重点中医专科（专病）中心。有国家药品临床研究基地3个。
学校积极开展国际交流与合作，拓展外部发展空间。我校为全国高等中医药院校中首批招收港澳台及外国留学生的单位，2009年获批为国家中医药管理局中医药国际合作基地。现有在籍留学生和港澳台侨学生373人。中国湖南国际针灸培训中心设于我校，已为30个国家和地区培训了千余名多名学员。1990年以来，学校先后多次选派专家、教授赴英国等20多个国家和地区留学访问，并派出数批医疗队赴俄罗斯等多个国家防病治病。与美国新英格兰中医学院、加拿大中央学院、香港大学、澳门科技大学、新加坡中医学院、日本青叶札幌等建立了医疗、教学、科研合作关系；与马来西亚林肯大学开展境外合作办学项目，成为我省首个境外合作办学项目。获批与韩国圆光大学共建孔子学院。
近年来，学校办学条件不断改善，办学规模稳步扩大，教学质量稳步提高，科研水平大幅上升，医疗服务水平不断提高，产业发展势头良好，已发展成为一所以本科教育为主、具有完整高等教育办学层次和多个学科门类、多种办学形式、办学综合实力较强的高等中医药院校。
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