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舟山共有2所本科大学，名单分别为浙江海洋大学、浙江海洋大学东海科学技术学院，其中浙江海洋大学简称“浙海大”，是中华人民共和国自然资源部与浙江省人民政府共建的高校，浙江省教育厅与舟山市人民政府共建重点高校。
| 学校名称 | 学校标识码 | 主管部门 | 所在地 | 办学层次 | 备注 |
| 浙江海洋大学 | 4133010340 | 浙江省 | 舟山市 | 本科 | |
| 浙江海洋大学东海科学技术学院 | 4133013282 | 浙江省教育厅 | 舟山市 | 本科 | 民办 |
舟山部分本科大学简介
浙江海洋大学东海科学技术学院（Zhejiang Ocean University Donghai Science & Technology College）位于浙江省舟山市，学院成立于2000年，是经中华人民共和国教育部和浙江省人民政府批准，以浙江海洋大学为依托创建的一所按民办机制运作的全日制普通本科院校。同时也是浙江省首批“加强应用型建设试点本科院校”。 2021 年 1 月，浙江医药高等专科学校与浙江海洋大学东海科学技术学院合并转设工作获得郑栅洁省长重要批示以及省教育厅、省财政厅、省药监局、舟山市政府大力支持，已进入实质性推进阶段。
浙江海洋大学（Zhejiang Ocean University），简称“浙海大”，是中华人民共和国自然资源部与浙江省人民政府共建的高校，浙江省教育厅与舟山市人民政府共建重点高校[，入选国家首批卓越农林人才教育培养计划，CDIO工程教育联盟成员单位，“一带一路”南南合作农业教育科技创新联盟单位，中国-中东欧“16+1”国家高校联合会成员。i>
学校创建于1958年，始名舟山水产学院，1975年更名为浙江水产学院，1982年成为全国首批学士学位授予高校之一，1998年与舟山师范专科学校合并组建为浙江海洋学院，2000年之后舟山卫生学校、浙江水产学校、浙江省海洋水产研究所、舟山石油化工学校和舟山商业学校等单位相继并（进）入，2006年获硕士学位授予权单位资格，2016年更为现名。
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