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新疆农业职业技术学院王牌专业排名有种子生产与经营专业、畜牧兽医专业、园艺技术专业、农畜特产品加工专业、农村能源与环境技术专业等，具体专业名单请参考以下表格。
双高计划高水平专业群建设名单：种子生产与经营、畜牧兽医
全国职业院校装备制造类示范专业点：农业装备应用技术
国家示范高职院校重点建设专业：种子生产与经营专业、畜牧兽医专业、园艺技术专业、农畜特产品加工专业、农村能源与环境技术专业
高等职业教育创新发展行动计划（2015—2018 年）认定骨干专业：园林工程技术、电子商务、种子生产与经营、商务英语、软件技术、农产品加工与质量检测、商务管理、动物医学、计算机网络技术、会计、水利工程、药品生产技术、园艺技术、食品加工技术、畜牧兽医、机电一体化技术
自治区级特色专业：计算机网络技术、农产品加工与质量检测、化工生物技术
自治区级重点专业：农业装备应用技术
新疆农业职业技术学院简介
新疆农业职业技术学院位于新疆昌吉市，是一所举办高等职业教育的公办全日制普通高等学校，学院是全国首批28所国家示范性高职院校，是新疆首批“高等职业教育与本科教育联合培养应用本科人才”试点高校、现代学徒制试点单位、全国职业教育先进单位、全国毕业生就业典型经验高校。
新疆农业职业技术学院前身是1958年2月创办的昌吉州合作干部学校，2000年6月新疆维吾尔自治区人民政府批准升格为新疆农业职业技术学院。
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