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菏泽学院王牌专业排名有体育教育、生物科学 、机械电子工程、化学工程与工艺、生物工程 、财务管理、音乐学等，具体专业名单请参考以下表格。
1、2019年度省级一流本科专业建设点：
体育教育、生物科学 、机械电子工程、化学工程与工艺、生物工程 、财务管理、音乐学
2、省高水平应用型专业群：化学工程与工艺、小学教育、财务管理等
3、省级卓越工程师培养计划专业项目：机械电子工程、食品科学与工程
4、山东省特色专业：生物教育、心理咨询、物理学、财务管理、化学工程与工艺、生物科学
5、山东省专业综合改革试点项目：财务管理
菏泽学院简介
菏泽学院位于山东省菏泽市，是一所全日制普通本科高校，入选数据中国“百校工程”项目建设院校。
菏泽学院的前身是创建于1949年的冀鲁豫区第二师范学校，历史上曾更名为平原省立菏泽师范学校、山东省菏泽第一师范学校、菏泽师范专科学校。2002年，菏泽师范专科学校、菏泽教育学院、菏泽广播电视大学3所学校合并，同时并入菏泽师范学校、菏泽农业学校，筹建菏泽学院。2004年，教育部正式批准更名为菏泽学院。2011年，单县幼儿师范学校、郓城幼儿师范学校并入菏泽学院。2017年，学校成为省级硕士培育建设单位。
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