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生物工程主要学什么就业方向有如下：
医药类企业：生物工程、产品研发、生物制药、技术开发、工程设计、生产管理、药物检测； 农林类企业：产品培育、植物组培、去病毒技术； 食品类企业：发酵工程、转基因技术。
生物工程专业是以生命科学、食品科学和工程学为基础，培养具备从事食品科学基础研究、食品生物高新技术创新、功能食品开发、食品原辅料生产、农产品综合利用、食品生物工程产业管理等方面能力的“生物技术 食品工程”复合型高级专业人才；旨在强调学生专业知识、基本技能、创新思维和科研能力的培养，注重应用研究、工程设计和产业管理的基本训练。
本专业涉及基因工程、细胞工程、蛋白质工程、酶工程、发酵工程和生物反应工程等生物工程教学和研究内容，要求学生掌握生物学、生化工程、化学工程等学科的基本理论和知识，掌握基因工程、酶工程、生化反应与催化工程、细胞培养和微生物发酵工程、生物分离工程和工程计算等方面的基本技术。
本专业学生主要研究现代生物工程技术及其产业化的原理、工艺过程和工程设计等方面的基本知识和技能，在制药、农林、食品等领域进行产品研发、生产、质量检测等。
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