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1、选拔阶段不同
直博从本科进行选拔，选拔优秀的本科生直接读博士。硕博连读是在研2时选拔，在此期间不需要做硕士论文，但是如果博士无法顺利毕业的话，可继续进行硕士论文，如果论文没有通过的话，就连硕士学位也没有了。
2、攻读时间不同
直博一般4-5年，硕博连读通常需要5年，招生单位一般鼓励学生提前毕业，经招生单位认定不宜继续攻读博士学位，可转为硕士研究生模式培养。
3、选拔方式不同
直博免试，只能从推荐免试攻读硕士学位的优秀应届本科毕业生中选拔。硕博连读则需通过招生单位组织的博士生入学考试或考核，被录取后才能进入博士阶段的学习。
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