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区别如下：
1、录取批次不同
四川大学是一本录取，四川大学锦江学院是独立学院，属于三本批次。
2、成立时间不同：
四川大学由原四川大学、原成都科技大学、原华西医科大学三所全国重点大学经过两次合并而成。原四川大学起始于1896年四川总督鹿传霖奉光绪特旨创办的四川中西学堂，是西南地区最早的近代高等学校；原成都科技大学是新中国院系调整时组建的第一批多科型工科院校。
原华西医科大学源于1910年由西方基督教会组织在成都创办的华西协合大学，是西南地区最早的西式大学和中国最早培养研究生的大学之一。1994年，原四川大学和原成都科技大学合并为四川联合大学，1998年更名为四川大学。2000年，与原华西医科大学合并，组建了新的四川大学。
四川大学锦江学院是2006年4月12日，教育部教发函〔2006〕78号批准四川大学与四川旭峰实业有限公司合作试办四川大学锦江学院。同年9月，学院首届1600余名学生到校报到、注册。
3、主管部门不同
四川大学主管部门是中华人民共和国教育部，四川大学锦江学院主管部门是四川省教育厅。
因此，这两个学校是两所完全不同的学校。
扩展资料：
四川大学科研机构：
1、国家重点实验室：水力学与山区河流开发保护国家重点实验室、高分子材料工程国家重点实验室、生物治疗国家重点实验室、口腔医学国家重点实验室
2、国家重大科技基础设施：国家生物治疗转化医学重大科技基础设施
3、国家工程技术研究中心：国家生物医学材料工程技术研究中心、国家烟气脱硫工程技术研究中心
4、国家工程实验室：制革清洁技术国家工程实验室、环保型高分子材料国家地方联合工程实验室、口腔再生医学国家地方联合工程实验室、能源植物生物燃油制备及利用国家地方联合工程实验室
5、国防重点学科实验室：视觉合成图形图像技术国防重点学科实验室
6、其他国家级重点实验室：国家空管自动化系统技术重点实验室
7、教育部重点实验室：
皮革化学与工程教育部重点实验室、辐射物理与技术教育部重点实验室、生物资源与生态环境教育部重点实验室、绿色化学与技术教育部重点实验室、靶向药物教育部重点实验室、
出生缺陷与相关妇儿疾病教育部重点实验室、先进特种材料及制备加工新技术教育部重点实验室（B类）、高能密度物理及技术教育部重点实验室（B类）、能源工程安全与灾害力学教育部重点实验室
8、教育部哲学社会科学重点研究基地：道教与宗教文化研究所、中国俗文化研究所、四川大学南亚研究所、四川大学藏学研究所
9、教育部工程研究中心：现代交通管理系统教育部工程研究中心、后续能源材料与器件教育部工程研究中心、磷资源综合利用与清洁加工教育部工程研究中心、环境友好高分子材料教育部工程研究中心、口腔转化医学教育部工程研究中心、医疗信息化技术教育部工程研究中心
10、卫生部重点实验室：口腔生物医学卫生部重点实验室、移植工程与移植免疫卫生部重点实验室、时间生物学卫生部重点实验室
参考资料：
-四川大学
-四川大学锦江学院
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