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上海交通大学，拥有12个王牌专业，也被称为上海交通大学的顶级专业，其中，有7个工科类专业：机械工程、控制科学与工程、船舶与海洋工程、材料科学与工程、信息与通信工程、动力工程及工程热物理和生物医学工程；3个医学类专业：临床医学、口腔医学、基础医学；2个理学类专业：科学技术史、生物学。
除了科学技术史，其他11个专业都是一级学科国家重点学科，其中，临床医学、生物学、基础医学、口腔医学、信息与通信工程下切二级学科国家重点学科。
上海交通大学的最顶尖专业都是热门专业，这也是上海交通大学历年分数线高的原因之一。
上海交通大学12个最顶尖专业排名：
根据排名机构对上海交通大学各专业负值后，得出排名：
1、机械工程、船舶与海洋工程、临床医学，稳居前三名！
2、动力工程及工程热物理、控制科学与工程两个工科学科进入前五名。
3、生物学、科学技术史，这两个理学专业，分别第六名、第七名。
4、口腔医学、基础医学，两个医学专业位居第八名、第九名。
5、生物医学工程、材料科学与工程、信息与通信工程，这三个工科学科分别位居第十名、第十一名、第十二名。
上海交通大学是一所综合类重点本科院校，拥有共28个最好专业（特色专业）。但是因为每个人关注的角度不一样，答案也有很多种变化。
上海交通大学微电子学、信息安全、信息工程、软件工程（设3个专业方向）、临床医学、口腔医学、生物技术、机械工程及自动化、信息工程、船舶与海洋工程、工业工程、医学检验、计算机科学与技术、生物医学工程、电气工程与自动化、土木工程、热能与动力工程、自动化、工程力学、生物工程、护理学、法学、电子科学与技术、环境科学与工程、化学工程与工艺、食品科学与工程、植物生物技术、核工程与核技术等专业可以说是上海交通大学最好最有特色的专业了，这些专业为同类型高校相关专业和本校的专业建设与改革起到示范带动作用。
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