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和ESI
相比，相应的MALDI
对有较大分子量、更强疏水性和更低
等电点
的肽的检测能力更强。对MS
检测器的最优选择基于何种应用。
离子化:
个人觉得MALDI
更高，因为相对来说单位的样品可以得到的能量更为集中，且激光的能量更为可控，所以我个人的理解是其离子化的效率更高些。ESI
在氮吹过程中应该存在大部分样品损失的情况。
传输效率:
我觉得这个仍然是
MALDI
更为有优势。大家知道，MS
的性能与其真空度是正相关的，MALDI
对真空度不存在直接的对应
使用环境
，即可以实现很好的真空度。而
ESI
则不行。MALDI
类型的质谱仪高灵敏度的实现我想有以上事实很大一部分的功劳。
两种离子源应该都是在其最优状态下进行工作，而且样品也是各自更为适用的类型。这样的讨论才具有可行性。
MALDI
在离子化效率问题上是弱于ESI
的，在离子传输效率上是强于ESI
的
ESI:
大分子且不易挥发。要加附加
电解质
使中性大分子带电而被分离。主要看
分子离子峰
(正离子分离:+
Na+,
K+等;负离子分离:+
Cl-等)
MALDI:
一般有机分子到大分子都可以。分子先被离子化，成碎片进入质谱分析仪。能看到
碎片离子
峰。能得到较多的
化学信息
国内的化学esi排名如下：
第一名 中国科学院大学
第二名 清华大学
第三名 中国科学技术大学
第四名 浙江大学
第五名 吉林大学
第六名 南京大学
第七名 南开大学
第八名 北京大学
第九名 天津大学
第十名 华南理工大学
第十一名 华东理工大学
第十二名 四川大学
第十三名 复旦大学
第十四名 大连理工大学
第十五名 苏州大学
三月九日，科睿唯安公布了ESI从2012年1月1日到2022年12月31日的统计数据。ESI每2个月公布一次，均为上一次数据的基础上增加2个月的数据，但是每年5月份会去除掉最旧一年的数据。
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