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影响太阳耀斑爆发时，不仅会严重危及宇宙飞行器内的宇航员和仪器的安全，无线电通信尤其是短波通信，以及电视台、电台广播,也会受到干扰甚至中断，太阳耀斑爆发时产生极光，并干扰地球磁场而引起磁暴。太阳耀斑对气象、水文以及动植物的生长等方面也有着不同程度的直接或间接影响。
耀斑成因太阳大气中充满着磁场，磁场结构越复杂，越容易储存更多的磁能。
当储存在磁场中的磁能过多时，会通过太阳爆发活动释放能量，太阳耀斑即是太阳爆发活动的一种形式。
长期的观测发现，大多数耀斑都发生在黑子群的上空，且黑子群的结构和磁场极性越复杂，发生大耀斑的几率越高。平均而言，一个正常发展的黑子群几乎几小时就会产生一个耀斑，不过真正对地球有强烈影响的耀斑则很少。
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